港琴物流通过整合公路、铁路、水运、海运、空运资源构建立体运输体系，形成定制化解决方案，实现成本和时间之间的最佳平衡，增加了供应链的灵活性来实现运力成本降低。
公路运输方面，港琴拥有充裕的车辆调度资源，满足全网总货量日均超3万吨的运输力量；成熟路由规划与多客户货物配载优化算法；通过智慧运力池，使运力和货物达到最优配置。
铁路运输方面，港琴整合铁路运输资源，凭借丰富的铁路运输经验，严把货物到达时效、降低损率。主要为高附加值产品提供直达快运服务，提高产品生命周期及加快资金流。相关铁路服务有五定班列、行邮、行包、批量运输、铁路集装箱等。
内河运输方面，港琴与国内众多江运公司密切合作，经营沿海及长江内贸集装箱班轮运输、大型项目运输、大件运输、散杂货运输、危化品运输、仓储服务、分理配送服务、船舶代理、集装箱管理等；同时提供门到门、门到港、港到港、港到门服务。
海运方面，港琴将国际海运的运营纳入运作体系，与国内大型海运公司保持良好的合作关系，为客户提供订仓、配载、报关、仓储、拼箱、集运、分拨、提运、送货、国际快件以及代保险等一系列物流服务，并依托公司完善的运输资源实现海陆空多式联运服务。
